Министър-председателят Пламен Орешарски изпрати съболезнователна телеграма до Негово Светейшество патриарх Неофит по повод кончината на Неврокопския митрополит Натанаил:
„Отмина във вечността един истински духовник, посветил живота си в служение на Българската православна църква. В лицето на митрополит Натанаил Светият Синод имаше в своя състав боголюбив и скромен духовник.
Веднъж захванал се с някаква задача, той работеше всеотдайно за изпълнението й без да жали сили. Тези, които добре го познаваха, знаят, че зад неговата скромност и смирение се криеше твърдият и безкомпромисен характер на верен съратник за защита на църковното единство.
Тъжно е, че думите на възхищение и преклонение към него идват, когато той вече не е между нас. Ще го запомним като деен и отговорен архиерей с добро сърце, даряващо любов и закрила на хората. Затова смъртта на Негово Вископреосвещенство е тежка загуба не само за хората от подопечната му Неврокопска епархия, но и за цялата Българска православна църква.
Поклон пред светлата му памет!”.